Методы генотипирования патогенных микроорганизмов

Abstract

Существуют различные фенотипические методы идентификации микроорганизмов, недостатки которых привели к формированию новейших инновационных способов типирования на основе последовательности ДНК микроорганизмов, которые сводят к минимуму проблемы с дискриминирующей силой и воспроизводимостью и, в некоторых случаях, позволяют создавать большие совместимые базы данных охарактеризованных организмов. В данном обзоре дается характеристика некоторых молекулярно-генетических методов типирования патогенных микроорганизмов, в том числе и основанных на полимеразной цепной реакции: MLVA, rep-PCR, WGS. Приведенные данные могут быть использованы исследователями в их практической деятельности, так как дают некоторые данные о их свойствах и значимости. Применение этих методов позволяет проводить долгосрочный эпидемиологический надзор над инфекционными заболеваниями, что в свою очередь повлечет к существенному сокращению числа инфицированных людей и устранению путей распространения заболеваний.