Филогенетические взаимоотношения p19-подобных белков экспрессируемые представителями семейства вирусов Tombusviridae

Abstract

P19-подобные белки, кодируемые различными вирусами, являются мощными супрессорами РНК-интерференции – основного молекулярного механизма борьбы растений с инвазивными патогенами. Вследствие длительных эволюционных процессов вирусы развили специфические белки, участвующие в подавлении РНК интерференции. Данная работа посвящена исследованию филогенетических взаимодействий трех родов семейства Tombusviridae, изученных на основе нуклеотидных и аминокислотных последовательностей супрессорных белков. Анализ содержал дискретные методы построения филогенетических деревьев. Полученные данные демонстрируют вероятность происхождения Р19 белка вирусов рода Tombusvirus и Zeavirus от одного общего предка. У вирусов, входящих в род Aureusvirus, выявлена функциональная утрата специфичности супрессора к количеству нуклеотидных последовательностей двухцепочечных молекул РНК. -спиралей в размерной специфичности к двухцепочечных РНК. Выдвинуто предположение о существовании нового рода в семействе Tombusviridae включающий вирус RicevirusA.